Ministerstvo nesouhlasí
Ministerstvo dopravy na zveřejněnou zprávu NKÚ zareagovalo vlastní tiskovou zprávou, ve které kromě jiného uvádí, že veškerá zjištění bere na vědomí a dílčí aspekty kritiky modernizace D1 respektuje. V celku ale považuje projekt za profesionálně provedený. Tiskovou zprávu NKÚ označuje ministerstvo dopravy za vytrženou z kontextu závěrečné kontrolní zprávy, která by neměla být interpretována tak, že modernizace nebyla povedeným nebo snad nedokončeným projektem.
Ministr dopravy Martin Kupka zároveň odmítá tvrzení NKÚ týkající se systémových otázek, jako je stav mostů a právě vysokorychlostní vážení. MDČR také připomíná, že pojem „dokončená modernizace“ se vždy týkal věcí přímo omezujících řidiče, nikoliv navazujících prací nebo kolaudací.
Na D1 se řidiči omezením nevyhnou ani po dokončení modernizace. Aktuálně probíhá oprava mezi Mirošovicemi a sjezdem na Velké Popovice. Tento úsek už ale nebyl součástí modernizace D1. Velké komplikace zejména v letní sezoně přinese rozšiřování dálnice v okolí Brna a možná ještě letos by se mohlo začít s opravou mostu Šmejkalka. Ten sice původně byl součástí modernizace, ale později byl z tohoto projektu vyjmut a začal se řešit samostatně.